通过上面的描述，我们可以看出尽管有明一代官方坚持建文帝死于火灾，但是民间人士和士大夫们对此种说法则不以为然，甚至最后连大明朝的最高统治者都开始怀疑了。其实建文帝或许没有死于火灾，而朱棣本人也很有可能知道这个事实，说实话最后从火堆中抢救出来的尸体都烧焦了，谁能确定那就是建文帝，当年也没有DNA鉴定，但是朱棣仍然坚持宣称建文帝死于火灾，并对抢救出来的尸骨进行厚葬，其实更多的是出于政治目的。就是为了掩人耳目、“绝天下人望”，毕竟如果正牌皇帝没死的消息传出去，指不定哪个藩王就打着建文帝的旗帜再来一场靖难了，而这是朱棣不能接受的，因此无论朱允炆死没死，对朱棣来说并不重要，他要的是一个死透了的朱允炆，这样看来焦尸反而更符合朱棣的需要，都烧的辨认不出是谁了，谁能说他不是建文帝，只要朱棣说他是建文帝，那他就是建文帝。朱棣为建文帝发丧的行为确实起到了效果，当时各省为对付燕王而招募的士兵在得知其厚葬建文帝的消息后纷纷自行解散，使得朱棣登基并没有触发新的战争。
然而如果焦尸不是建文帝的话，那朱棣厚葬的又是谁？焦尸很有可能是建文帝的皇后，大明朝第二位马皇后，史书记载朱棣攻入南京城的时候马皇后是自焚而死的，同样有明确记录，然而史书却没有提及朱棣对这位死去的侄媳妇的后续处理措施，这是很不合常理的。要知道建文帝的生母吕氏在建文帝在位时被尊为皇太后，朱棣即位后为了法统自然不能承认这个“伪太后”了，所以特地将其改封为皇嫂懿文太子妃，并安排其住到懿文太子陵旁边，为太子守陵。同样是“自焚”而死的建文帝也得到了朱棣的厚葬了，马皇后毕竟曾经当过皇后，是朱允炆的原配，那么相应的马皇后也应该得到厚葬，而且按照礼制来说应该跟建文帝合葬在一起。